JTとの研究開発に係る機能分担において、新規化合物の研究開発機能はJTに集中しております。
JTでは「国際的に通用する特色ある研究開発主導型事業の構築」による「オリジナル新薬の開発」を目指し、研究開発力の充実・強化を図るべく、積極的に経営資源を投入しています。
6つの研究所からなるJT医薬総合研究所では、各研究所が有機的に連携を図りながら、重点研究開発領域（糖・脂質代謝、免疫・炎症、ウイルス）で新薬の研究開発を行っています。